單細胞基因組擴增有哪些好處
加入時間:2016-06-21 11:33:24 當前新聞點擊率:2887
研究人員通常會在下游分析中遭遇DNA樣本量有限或不足的問題。做為一種增加有限DNA量的方法,全基因組擴增技術于1992年出現,該方法特別適于法醫學鑒定和遺傳疾病的研究,以及如二代測序技術和CGH陣列(比較基因組雜交)等新技術應用,后者的主要難題就在于DNA樣本數量有限,但分析需求量又很可觀。單細胞基因組擴增優化了等溫擴增的反應體系,可實現微量樣本全基因組無差別擴增。 使用高度續進性的Phi29聚合酶得到的長DNA片段確保了Phi29擴增得到的DNA覆蓋了整個基因組,連貫并且無偏地擴增所有遺傳位點。在有偏的研究中,使用MDA、DOP–PCR和PEP技術對不同數量的基因組DNA進行擴增(0.3–300 ng)。使用定量檢測real-time PCR確定8個遺傳位點相對的表達量。通過與1 μg未擴增的對照DNA作比較,可以確定遺傳位點的表達。由于未消除的二級結構會導致不同位點的不等同擴增,基于PCR的WGA方法(比如DOP–PCR或者PEP)經常會導致遺傳位點丟失。MDA具有最好的DNA擴增覆蓋效果,并且將遺傳位點丟失的風險降到了最低。 普朗醫療生產的這款全基因組擴增(Whole Genome Amplification)是一種對全部基因組序列進行非選擇性擴增的技術,其目的是在沒有序列傾向性的前提下大幅度增加DNA的總量。采用MDA(多重鏈置換擴增)的方法,能夠在16個小時之內,將ng甚至是pg級的微量DNA有效擴增至10-40μg高覆蓋度的全基因組DNA。
(普朗醫療品牌----全基因組擴增試劑盒) 這款全基因組擴增試劑盒已經把擴增后的產物進行二代測序,覆蓋度能達到90%以上,各條染色體基因組的偏差基本一致;同時,我們隨機選取了10個SNP位點進行擴增,起始樣本和擴增后的樣本均有相應的特異性條帶,基本沒有差異。想了解更多的內容和資訊的話可以撥打免費電話:400-6656-888進行咨詢。 相關閱讀: 下一篇:
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